SoftGenetics NextGENe 2.4.2.3破解版下载

软件下载 11月 13, 2023 0 king

NextGENe是分析由ION PGM™，Roche Junior，Illumina MiSeq以及高通量系统（如Ion Torrent Proton，Roche FLX，Applied BioSystems SOLiD™和Illumina®平台）生成的桌面测序数据的完美分析合作伙伴。NextGENe软件在Windows®操作系统上运行，分享生物学家友好的知识兔点击界面，不需要脚本或其他生物信息学支持，在使用CLC Bio，LaserGene，DNASTAR，MAQ，SOAP，Top等程序时通常需要支持帽子，BWA和Bowtie。

NextGENe软件在一个独立的多应用程序包中采用了独特的平台特定技术。NextGENe软件包含用于SNP / INDEL和结构变异分析（重测序和扩增子分析），拷贝数变异（CNV），预测和罕见疾病发现的分析模块; 全基因组比对;转录; 外显子和转录物表达水平的交替剪接; RNA Seq; ChIP-Seq，基因表达系列分析（SAGE）分析; 数字基因表达（DGE），外显子组装和变体发现; miRNA分析和定量;宏基因组学; de novo assembly，CNV和Exome Capture。

NextGENe 2.4.2.3包含用于筛选拷贝数变异的新批量CNV工具，知识兔用于从大多数市售化学品中去除重复读数的独特分子标识工具，知识兔以及用于分析来自NEBNext Direct Cancer HotSpot面板和Direct BRCA面板的数据的模板。该软件还分享读入定相功能，知识兔用于与各种基因组构建共享参考轨道的工具，知识兔以及与轨道管理器集成的预加载参考。该软件与SoftGenetics的遗传学家助手NGS Workbench集成。
NextGENe的AutoRun工具允许用户快速设置作业文件，知识兔以指定用于分析多个项目的样本文件，参考文件和设置。NextGENe AutoRun扫描作业文件以检查处理作业所需的所有文件的可用性。当文件可用时，NextGENe AutoRun启动NextGENe以开始处理作业。工作连续处理。如果知识兔某些文件不可用，NextGENe AutoRun将定期以NextGENe AutoRun设置中指定的时间间隔重新检查文件。知识兔可以轻松编辑作业文件以添加其他作业或编辑尚未处理的作业。
此外，当NextGENe当前正在处理另一组作业时，知识兔可以将其他作业添加到队列中。一旦第一个列表完成，NextGENe将自动开始排队的下一个作业列表。NextGENe可用于分析来自Illumina GA，MiSeq和HiSeq系统，Roche / 454 GS FLX，FLX Titanium和Junior，Applied Biosystems的SOLiD系统，Ion PGM和PacBio平台的下一代测序数据。分享多种应用类型，知识兔包括SNP / Indel分析，RNA-Seq，知识兔从头组装和ChIP-Seq。结果显示在交互式NextGENe Viewer中，分享了其他商业程序中没有的详细可视化，如Lasergene的SeqMan Pro，CLC Bio和DNASTAR的NGEN，或者在TopHat，Bowtie和BWA等开源工具中。